总会成立于1993年，前身是“深圳市社会团体总会”，2008年9月更为现名，业务主管单位是深圳市民政局。同年，在市委、市政府颁布的《关于进一步发展和规范我市社会组织的意见》中，明确要求“充分发挥市社会组织总会在联系政府与各社会组织的桥梁纽带作用，促进社会组织的规范发展。”在《深圳市社会组织发展规范实施方案》中提出：“发挥深圳市社会组织总会的综合平台作用，承接政府部门和事业单位委托的关于社会组织的法规起草、政策研究、专业评估等事项、开展社会组织孵化、培训和能力提升等工作。”总会服务对象为市本级依法登记的社会团体、社会服务机构、基金会，同时辐射区级社会组织，现有优质社会组织团体会员526家。